【港大研究】港大創新平台快速追蹤新冠病毒變異株 較傳統方法提速39倍
發布時間: 2024/04/04 15:37
最後更新: 2024/04/04 18:00
來自香港大學李嘉誠醫學院及工程學院的跨學科研究團隊成功研發創新的篩選平台,可快速評估新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)變異對疾病嚴重程度的影響。相較傳統方法,這種新方法速度提升多達39倍。此外,研究人員專注了解病毒變異如何影響合胞體形成,即受感染細胞與未感染細胞融合的過程,這有助識別可能對公共衞生構成重大風險的新興病毒變異株。該團隊還確定了兩種已獲美國食品藥物管理局(FDA)批准的藥物,可以減輕疾病嚴重程度。有關研究結果已發表在《自然-生物醫學工程》,並已申請專利。
傳統追蹤新型冠狀病毒的檢測方法要求高且成本昂貴。研究團隊因而研究利用創新的篩選方法和先進的基因技術,識別促進合胞體形成的特定基因和細胞因子。這項研究有助開發有效的干預和治療方法,以阻止細胞融合並限制病毒傳播。
該團隊採用分裂綠色螢光蛋白特別系統,當細胞融合時會產生可檢測的螢光信號。他們將其與微流控技術和深度突變掃描的系統相結合,創建一個新平台用於快速篩選和分析各種刺突蛋白變體的融合能力。
通過研究刺突蛋白及其突變,研究人員發現某些變異株,如Delta變異株,與病毒原始株相比形成較大的合胞體。他們發現單個K854H突變可以將Omicron變異株轉變為具有高融合能力的變異株。此外,研究中發現的一些變異,系統預測出它們與Omicron和Delta等現有變異株具有相近的變異機率,顯示這些新變異應該受到監控,因為它們可能在未來病毒演變中出現。
為提高篩選效率,團隊開發了一種根據細胞大小篩選的策略,以在更大範圍上將融合和未融合的細胞進行高速篩選;與傳統方法比較,新方法的精確度超過80%。
團隊除了利用大小排序策略,亦結合全基因組篩選,並確定兩個與細胞內吞作用有關的細胞因子——AP2M1和FCHO2,它們會促進合胞體形成。研究人員隨後以細胞內吞作用作為治療靶點,測試兩款現時用於抗精神病的FDA批准藥物的成效——氯丙嗪和氟伏沙明。倉鼠模型實驗顯示,這些藥物可以抑制由刺突蛋白誘導的合胞體形成,並有潛力緩解病情。
這項研究的意義在於採用跨學科方法,結合大批量基因篩選、深度突變掃描、液滴微流控技術和病毒學。液滴微流控系統有助實現以大批量方式研究細胞間的相互作用並提供高分辨率的數據。此細胞互作平台可系統地分析多種病毒的合胞體形成能力,包括愛滋病毒、呼吸道合胞病毒、疱疹病毒科、新型冠狀病毒和其他誘導合胞體形成的冠狀病毒。結合大批量分析系統和基因篩選,研究團隊發現兩個潛在的治療靶點,可以抑制合胞體形成,並減輕感染新型冠狀病毒的嚴重程度。
領導這項研究的港大醫學院生物醫學學院副教授黃兆麟表示,這些創新系統不僅助團隊快速追蹤新型冠狀病毒變異並找出治療方案,還可以廣泛應用於各種與細胞融合相關的生物醫學研究,包括癌症免疫療法。
他展望,從這項研究中獲得的嶄新方法和深入知識有望為公共衞生工作作出貢獻,並為治療2019冠狀病毒病症和其他涉及細胞融合的疾病提供新策略。
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責任編輯:陳麗娜